Le musée séfarade est situé à l’intérieur de la synagogue de Samuel ha-Levi ou, comme on l’appelle communément, la synagogue d’El Tránsito, l’édifice hispano-juif le plus important d’Espagne, situé au cœur du quartier juif de Tolède.

L’origine de cet édifice spectaculaire remonte au XIVe siècle, lorsqu’il fut construit sur ordre de Samuel ha-Leví, un personnage important de l’époque, qui occupa plusieurs postes importants à la cour du roi Pedro Ier de Castille, tels que celui d’Oidor de la Audiencia, de diplomate et de trésorier royal.

Il s’agit actuellement d’un musée d’État dépendant du ministère de la culture et des sports, rattaché à la direction générale des beaux-arts et géré par la sous-direction générale des musées d’État, dont la mission principale est de préserver et de transmettre l’héritage hispano-juif et sépharade en tant qu’élément fondamental de l’histoire de l’Espagne.

Le musée, tel que nous le connaissons aujourd’hui, a été créé en 1964 et déclaré « musée national d’art hispano-juif » en 1968. En 1969, la synagogue d’El Tránsito se dissocie des fondations Vega-Inclán, l’organisation qui la gérait depuis le début du XXe siècle, et entame sa trajectoire en tant que centre indépendant.

En 1971, le musée a ouvert ses portes au public et, depuis lors, il a fait l’objet de plusieurs améliorations, avec un plan de remodelage complet du bâtiment pour l’adapter aux besoins muséologiques actuels, ainsi qu’un nouveau projet muséologique et muséographique.